variables_研究发现系统性红斑狼疮易感长非编码基因SLEAR

系统性红斑狼疮(SLE)是一种自身免疫性疾病，主要发生于育龄妇女。男女发病率之比约为1:9，中国的发病率约为31-70/10万。一般认为系统性红斑狼疮与遗传因素、环境因素及其相互作用有关，其中遗传因素起着重要作用。全基因组关联研究(GWAS)发现了100多个与系统性红斑狼疮易感性相关的单核苷酸多态性位点，其中大部分没有改变蛋白质的氨基酸序列GWAS侧重于寻找蛋白质编码基因及其调控区的疾病易感性位点，而在一定程度上忽略了非编码基因区域的易感性位点，从而忽略了非编码基因在疾病发生发展中的重要作用

最近，美国风湿病学会关节炎和风湿病杂志发表了中国科学院院士的在线文章，中国科学院生物物理研究所研究员陈润生的研究组题为“SLEAR中的多态性RS 13259960易患系统性红斑狼疮”。首次报道系统性红斑狼疮易感长非编码基因，命名为SL耳。通过一系列体内外实验系统，阐述了易感位点rs13259960与SLEAR的调控关系，以及SLEAR在系统性红斑狼疮发生发展中的作用机制和分子途径。安徽医科大学张学军教授的团队于2009年在中国发表了首个系统性红斑狼疮全基因组关联研究研究人员从GWAS资料中发现位于长非编码基因内含子区的一个单核苷酸多态性位点rs13259960与系统性红斑狼疮显著相关，并将其命名为长非编码基因SLEARSLEAR在PBMC系统性红斑狼疮患者中的表达水平明显低于正常对照人群，在rs13259960位点突变的系统性红斑狼疮患者中的表达水平更低。通过实验发现，rs13259960位于SLEAR的增强子中。该位点的突变将削弱STAT1与增强子的结合，从而影响SLEAR的表达水平SLEAR可以与ILF2、hnRNPF和TAF15结合形成一种核糖核酸和蛋白质的复合物，以调节和控制抑制凋亡的基因的表达。体外实验表明，SLEAR能调节细胞凋亡，SLEAR在系统性红斑狼疮患者中的表达水平也与细胞凋亡显著相关。SNP位点突变导致SLEAR水平降低，进一步增加细胞凋亡。

这项研究工作充分利用了各种高通量测序技术，包括MAPS、ChIP-seq、ChIRP-seq等。高通量测序和数据分析工作由生物物理研究所高通量测序中心完成通过这项研究，高通量测序中心建立了一个综合各种高通量测序技术的整体解决方案，用于疾病的精确医学研究。

陈润生生物物理研究所、复旦大学华山医院张学军教授和中日友好医院崔永教授是本文的合著者生物物理研究所高通量测序中心高级工程师范震和安徽医科大学博士刘璐是本文的共同作者。本文获得了中国科学院、国家自然科学基金